Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IKZF1Q13422 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms