Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP1Q13363 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP1Q13363 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms