Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3FQ13275 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms