Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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