Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms