Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC15Q0P6D6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms