Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms