Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PLCB3Q01970 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLCB3Q01970 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLCB3Q01970 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLCB3Q01970 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms