Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAMQ00059 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms