Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKOR1P84550 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms