Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms