Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTBP60709 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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