Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NME5P56597 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NME5P56597 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
NME5P56597 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NME5P56597 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NME5P56597 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NME5P56597 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NME5P56597 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NME5P56597 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NME5P56597 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NME5P56597 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NME5P56597 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms