Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRE11P49959 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRE11P49959 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRE11P49959 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRE11P49959 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms