Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms