Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms