Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCAP37840 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCAP37840 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms