Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PPARGP37231 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PPARGP37231 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PPARGP37231 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PPARGP37231 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PPARGP37231 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PPARGP37231 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PPARGP37231 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PPARGP37231 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PPARGP37231 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PPARGP37231 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PPARGP37231 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PPARGP37231 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PPARGP37231 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PPARGP37231 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARGP37231 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARGP37231 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms