Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP62P37198 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP62P37198 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP62P37198 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP62P37198 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP62P37198 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP62P37198 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP62P37198 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP62P37198 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms