Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC27P30260 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC27P30260 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC27P30260 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC27P30260 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC27P30260 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC27P30260 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC27P30260 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC27P30260 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms