Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms