Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYF6P23409 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYF6P23409 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MYF6P23409 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYF6P23409 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms