Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms