Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms