Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF6O75683 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF6O75683 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SURF6O75683 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SURF6O75683 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SURF6O75683 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SURF6O75683 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms