Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms