Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NIN4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NIN4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NIN4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NIN4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NIN4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms