Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAV20-201ENST00000390448 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PYY3-201ENST00000419078 213 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FOLR2-204ENST00000454954 951 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR2110-201ENST00000459421 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB8P3-201ENST00000510182 803 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005841.1-201ENST00000547042 287 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT18P7-201ENST00000557241 1219 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091153.4-201ENST00000570493 480 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOB-205ENST00000572954 331 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL733P-201ENST00000582253 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL248P-201ENST00000615117 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL453P-201ENST00000620275 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRT-212ENST00000620410 940 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01667-203ENST00000623933 668 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ABHD11-AS1-202ENST00000641969 358 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01660-204ENST00000619172 3572 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PRR5L-201ENST00000378867 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ELF5-202ENST00000312319 2450 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RIMBP2-202ENST00000535703 3685 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RGPD2-201ENST00000398146 6931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092611.1-201ENST00000514269 2565 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A18P-201ENST00000527117 1395 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A19P-201ENST00000533611 1395 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RIC3-203ENST00000343202 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097375.3-201ENST00000515329 2652 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008132.1-201ENST00000419447 2068 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF19-204ENST00000611931 2051 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF26-205ENST00000615219 2051 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms