Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM19-204ENST00000438528 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SYTL4-202ENST00000276141 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GFM1-210ENST00000486715 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC240565.2-201ENST00000623180 2096 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK20-204ENST00000375883 2301 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB6-205ENST00000428609 2576 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 XKRX-201ENST00000372956 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WASF1-204ENST00000392586 2815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01163-202ENST00000630252 3086 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCH10-203ENST00000544856 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNA2-214ENST00000496558 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-208ENST00000369001 3685 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 APPL2-202ENST00000539978 2680 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RCBTB1-202ENST00000378302 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MICALCL-201ENST00000256186 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TAS1R2-201ENST00000375371 2542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF18-205ENST00000580613 2250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CSMD2-203ENST00000373377 3212 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SAA2-201ENST00000256733 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R14D-201ENST00000299174 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2T35-201ENST00000317450 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP178-201ENST00000365005 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms