Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAN1Q9Y2M0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms