Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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