Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALKQ9UM73 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms