Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APEX2Q9UBZ4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APEX2Q9UBZ4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms