Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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