Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL2Q9NX52 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms