Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FANCLQ9NW38 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCLQ9NW38 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms