Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT82Q9NSB4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms