Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4AQ9H788 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms