Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB1BQ9H0U4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB1BQ9H0U4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB1BQ9H0U4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB1BQ9H0U4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB1BQ9H0U4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB1BQ9H0U4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB1BQ9H0U4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1BQ9H0U4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms