Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms