Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REPIN1Q9BWE0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms