Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM208Q9BTX3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM208Q9BTX3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms