Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms