Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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