Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms