Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms