Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms