Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC4Q6S5L8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC4Q6S5L8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms