Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REEP3Q6NUK4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms