Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms